1689 m. – Pirmoji medinė koplyčia Šakiuose, tuomečiame Šakaičių kaime.
1703 m. – Gelgaudiškio kunigai liovėsi lankę Šakaičius ir koplyčioje atlikinėti apeigas.
1748 m. – pirmoji medinė bažnyčia – Gelgaudiškio prapijos folija.
1801 m. – įsteigta Šakių parapija.
1823 m. - perstatyta ir padidinta bažnyčia, inicijavo Seinų vysk. P. Strašinskis.
1840 m. - konsekravo Šv. Jono Krikštytojo titulu.
1935-09-08 Vilkaviškio vysk. A. Karosas pašventino naujos bažnyčios pamatus.
1939 m. – II bažnyčia, kurią 1940-12-08 pašventino vysk. V. Padolskis ( vokiečių sugriauta 1944 m. vasarą). Per karą sudegė ir senoji medinė bažnytėlė.
1945 m. - laikina koplyčia klebonijoje.
1945 - 47 m. – parapijiečių ir kleb. A. Gustaičio dėka prikelta iš griuvėsių antroji mūrinė bažnyčia.
1973 m. – pašventinti bažnyčios altoriai, lubos išpuoštos gipsatūra.
Vėliau bažnyčios atstatymo, užbaigimo ir išpuošimo darbais rūpinosi klebonai: kun. Albinas Jaudegis, kun. Juozas Matulevičius ir kun. Juozas Žemaitis, Šakiuose išdirbęs 22 metus.
Šv. Jono Krikštytojo bažnyčia Šakiuose turi modernistinio renesanso bruožų, stačiakampio plano, vienabokštė. Bažnyčios vidus - trijų navų, vidurinioji aukštesnė. Šventoriaus tvora metalinė, papuošta kryželiais. Šventoriuje palaidotas kun. A. Samuolis ( 1915- 1987), buvęs tremtinys, Šakiuose dirbęs nuo 1967 metų.
Šalia Šv. Jono Krikštytojo bažnyčios Šakiuose veikia Šakių Dekanato muziejus.
KAINORAŠTIS:
Muziejus išsilaiko iš aukotojų lėšų. Lankymas nemokamas. Kainos nenustatytos.
MUZIEJAUS DARBO LAIKAS:
I - V 9 – 14 (arba pagal susitarimą).
